Teppei's Diaryを簡単にご紹介

研究に関係のありそうなことを淡々とまとめています

Systematic Quantification of Sequence and Structural Determinants Controlling mRNA stability in Bacterial Operons

合成生物学者の誰もが、不確実性につながる設計をします。

普通とは逆の考え方です。

 

プロモーターがスワップされたり、RBSが再設計されたり、オペロン遺伝子の順番が乱れたりしたらどうなるのでしょうか?

 

共通のプロモーターのスワップは、5'UTRの変化につながる可能性がある。RBSの再設計はmRNAの構造を変化させる。遺伝子の並び順が乱れ、遺伝子間と5'UTR領域が入れ替わることで、CDSのためにmRNAの安定性/減衰(およびそれゆえ発現)が最大10倍に上昇/下降することがあります。

 

mRNAの崩壊は、いくつかのRNAsesと分解経路が同時に発生しているため、研究/モデル化/予測が困難です。また、転写や翻訳にも結合しています。

 

彼らは5つの相互作用に着目したとのこと

 

https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acssynbio.0c00471